Proteiini -bar -koneen toimintaperiaate sisältää pääasiassa raaka -aineiden käsittelyn, suulakepuristuksen muovaamisen, jäähdytys-, leikkaus- ja pinnoitusvaiheet. Ensinnäkin raaka -aineet, kuten soijaproteiini, makeutusaineet, pigmentit ja hedelmämaut, sekoitetaan tietyssä osassa, ja sekoittamiseen ja sekoittumiseen lisätään sopiva määrä vettä tasaisen emäksisen seoksen muodostamiseksi. Sitten seos lähetetään suulakepuristimelle suulakepuristusta varten, joka on proteiinipalakoneen ydinprosessivaihe. Suulakepuristimen ontelossa raaka -aineet suulakepuristetaan ja pyöritetään proteiinipalkin muodon ja paineen muodostamiseksi varmistaen, että lopputuotteella on hyvä maku- ja laatuvakavuus.
Muodostettu proteiinipalkki on jähmettyä jäähdytystunnelin avulla varmistaakseen, että siirappi ja muut sisällä olevat aineet ovat täysin jähmettyneet ja tarjoavat riittävän lujuuden. Jäähdytetty proteiinipalkki leikataan sitten siistiksi suorakulmaisiksi nauhoiksi leikkauslaitteella. Lopuksi leikattu proteiinipalkki kulkee päällystyslaitteen läpi, ja pinta on peitetty suklaakerroksella tai muulla päällysteellä lopputuotteen muodostamiseksi.